免疫遗传学

探索遗传学和免疫反应之间的关系

免疫遗传学是免疫学的一个分支,探索遗传学和免疫系统的反应之间的关系。基因测序使科学家们能够识别诸如风湿性关节炎(RA)、牛皮癣、多发性硬化症(MS)和系统性红斑狼疮(SLE)等免疫疾病的危险因素,并极大地改善了移植实践。1、2

新一代测序(NGS)技术的进步加快了对个体候选基因如何促进自身免疫性疾病发展的理解。此外,NGS还通过提供更好的人类白细胞抗原(HLA)分型(一种对干细胞、骨髓和实体器bob下载地址官移植至关重要的方法),改善了移植研究。2

NGS在自身免疫性疾病中的应用

自身免疫性疾病是由自适应免疫触发的,通过抗体对抗身体自身细胞。多种基因被认为是自身免疫性疾病的病因,环境因素也起着重要作用。3.因此,除了直接检测致病突变外,还必须分析由于暴露于环境因素而发生的表观遗传修饰。使用NGS的表观遗传分析询问候选基因的甲基化状态(Methyl-Seq)或染色质修饰(ChIP-Seq)。

NGS提供了大量免疫系统的高通量分析和识别低频变异的能力,这在RA等自身免疫性疾病中很重要。全外显子组测序(WES)对鉴别MS(另一种自身免疫性疾病)中有限样本量的罕见变异有重要作用。

应用NGS进行HLA分型

在人类中,一组编码HLA的基因控制着免疫反应,而在其他物种中,HLA相当于主要组织相容性复合体(MHC)。HLA有助于区分自我和非自我,参与调节先天和适应性免疫反应。

HLA分型是器官移植前评估供体和受体相容性的常用程序。它也被用来鉴定与发展遗传免疫疾病易感性相关的变异。

考虑到HLA区域是人类基因组中最具多态性的区域,4它的准确表征是至关重要的。历史上,HLA分型是通过蛋白酶的血清学毒性方法在表型水平上进行的。5快速的结果是这些方法的一个主要优点。然而,表型测试无法获得对HLA分型至关重要的等位基因特异性信息。分子技术的进步使得等位基因水平的基因型鉴定成为可能。NGS作为HLA分型的常规方法在移植中得到越来越多的应用,特别是在造血细胞移植和实体器官移植中,等位基因水平的分辨至关重要。4RNA测序(RNA- seq)尤其有价值,它可以提供准确的HLA分型、高通量和相关HLA基因表达信息,这些都对移植的结果至关重要。4

利用NGS进行HLA测序在免疫遗传学中有显著的贡献,尤其有利于避免分型结果不明确。

罗氏提供优越的NGS样品制备试剂,解决HLA分型和其他免疫遗传学研究应用中的样品制备相关问题。bob下载地址

  1. 马,史,李等。新一代测序在系统性自身免疫性疾病中的应用。基因组学、蛋白质组学和生物信息学。2015。13:242 - 249。

  2. bravoo - egna V和Monos D.下一代测序对免疫遗传学的影响:现状和未来方向。咕咕叫。当今。器官。移植手术。2017。22:400 - 406。

  3. Surace A和Hedrick C.表观遗传学在自身免疫性/炎性疾病中的作用。《免疫学前沿》2019。doi: 10.3389 / fimmu.2019.01525

  4. 移植中HLA分型的过去、现在和未来。方法和协议,分子生物学的方法。(ed) Boegal S.2018。第1章。182:1-10。

  5. Berger A. HLA分型。BMJ。2001.322; 7280:218。