全外显子组测序

专注于基因组的编码区域

全外显子组测序(WES)覆盖了95%以上的外显子(基因组的表达区或蛋白质编码区),其中包含了大多数与人类疾病表型相关的大基因变异和单核苷酸多态性(SNPs)。1在包含人类基因组的〜3×109碱基中,仅通过编码序列表示约1%。1通过专注于该基因组的最相关部分,WES提供了研究人员更有效地使用测序和分析资源的能力。bob下载地址WES策略通过缩小通过在人类基因组项目中识别的约350万SNPS中筛选诸如HAPMAP等数据库进行研究的变体细节。这种重点使得能够发现和验证致病基因和常见和罕见的变种的更简单方法。已经证明了exome测序可用于鉴定罕见的孟德尔疾病中涉及的突变。2

全基因组测序(WGS)对整个外壳测序

WGS和WES都有各自的优势。了解它们之间的主要差异有助于确定哪种方法最适合特定的研究目的。bob下载地址

  • WES仅覆盖基因组的表达区域,而WGS为两个外显子(表达序列)和内含子(所述介入序列)提供覆盖率
  • WES使用针对特定感兴趣区域的探针的富集策略,而WGS使用参考基因组来校准基因组的所有序列
  • 由于需要对整个基因组进行测序,WES比WG更具成本效率

为什么整个Exome测序?

  • 能够全面覆盖外显子以靶向医学相关的基因组区域,包括已知的疾病相关的地点和未翻译的地区(UTRS)
  • 增加变体发现潜力,包括使用下一代测序(NGS)技术的罕见和低频突变
  • 消除了序列整个基因组的需要,为WG提供了成本效益的替代方案

WES可以在多种情况下有用:

  • 致病基因已知特定疾病(单一的单一)并且需要研究以寻找特定变体
  • 在致病基因未知的情况下,需要调查
  • 在怀疑多种基因涉及特定疾病的情况下(多基因)

韦斯是怎么工作的?

在图书馆制剂期间,基因组DNA是碎片化的,并且通过使用生物素化的寡核苷酸探针在溶液中杂交来捕获靶区域。使用链霉抗生物素蛋白珠粒分离捕获的靶序列,并在洗涤和洗脱步骤后用于随后扩增和测序。

Roche测序解决方案为NGS样品制备提供整体套装产品,从样品QC,靶向富集到文库定量,使得能够制备高质量的DNA文库,以获得高质量的整体exome测序数据至关重要。

  1. Rabbani等。医学遗传学中全外显子组测序的前景。2014,人类遗传学杂志,59,5-15。
  2. 杨等人。临床全外膜测序为孟德利亚疾病的诊断。2013. N ENGL J MED。369:1502-1511。