有针对性的测序

将你的测序工作集中在感兴趣的基因组区域

目标测序提供了独特的见解,特定区域的利益基因组。它是研究多种疾病领域的一个强大的应用程序,如肿瘤学,遗传疾病,免疫学和传染病。这一应用程序允许特定的基因,编码区域,甚至染色体片段的定位精度和效率。

靶向测序比全基因组测序(WGS)更具成本效益。它还能够比WGS和其他调查方法更深入地分析结果。此外,它允许更深入的测序,而覆盖面的深度有助于避免测序数据的错误解释。由于这种敏感性,靶向测序在癌症研究、疾病相关突变的识别、单基因失调和基因表达研究中提供了巨大的优势。bob下载地址对特定区域的靶向测序也能发现罕见疾病的致病基因。靶向测序的重点方法提供了其在靶向治疗应用和个性化医学努力的可能性。例如,对多态人类白细胞抗原(HLA)基因进行定向重测序有助于HLA分型,这对于造血干细胞或实体器官移植的匹配至关重要。

靶向测序的好处

  • 允许检测和量化罕见和低频变异
  • 支持更高的覆盖率,更深入的测序和直接的数据分析
  • 提供成本效益、时间和资源节约和精度
  • 为后续的生物信息学分析提供更易于管理的数据集
  • 允许比全基因组测序更多的样本被分析

靶向测序是如何工作的?

目标测序的样品制备流程需要一个额外的目标富集步骤。它使用用户定义的探针集来丰富感兴趣的特定基因组区域,从而只导致该区域被测序。目标富集的两种方法是基于杂交或扩增。杂交法使用探针捕获感兴趣的区域,而扩增法使用PCR扩增目标。

基于杂交的目标富集方法

在混合捕获方法中,该过程以标准库准备工作流开始。DNA通过剪切或使用酶分裂。然后添加特定于测序平台的适配器。接下来,将它们与生物素化的寡核苷酸探针池孵育,这些探针的目的是针对DNA片段库中的特定区域。最后,用链霉亲和素包被的磁珠来吸引生物素化的探针/靶杂交体。这种方法的结果是一个测序准备库,高度富集的目标DNA。

基于pcr的目标富集方法

在基于PCR的方法中,单倍PCR和多重PCR反应都可以使用。在多重PCR中,多个引物针对不同的目的基因在一次反应中产生多个扩增子。扩增后,对多重PCR产物的浓度进行归一化处理。然后对合并后的产品进行排序。虽然这种方法有效且易于使用,但由于试剂成本高,对于靶向大的基因组区域并不理想。靶标扩增失败和PCR偏倚是与基于PCR的富集方法相关的其他缺点。

我们的罗氏公司提供

稳健的目标富集和最大分子复杂性和最小偏差的文库构建对于靶向测序的应用至关重要。罗氏提供了性能优化的杂交探针,既可以作为固定设计,也可以作为定制面板。

此外,罗氏还提供了一种集成的样品制备方法样品制备的解决方案包含了将一个样本转换为一个准备测序的库所需的所有步骤(从样本收集到量化)。