目标富集

丰富对下一代测序的目标区域

目标浓缩是一种成本效益,有效的研究人员,用于捕获图书馆准备NGS后的特定感兴趣区域,并且与全基因组测序(WGS)具有许多优势。bob下载地址

目标丰富使重点测序资源能够降低成本和简化分析。1该技术增加了与基因组中的所有其他基因相比测序靶区域的DNA片段的概率。结果,可以忽略其余的基因组,简化了下游生物信息学分析。它还提供了更大的测序深度,这有助于防止对测序数据的错误解释。此外,它增加了NGs检测来自有限样品量的变体并增加灵敏度的能力。由于该测序深度和敏感性,靶富集是癌症研究的变体呼吁的价值,鉴定疾病相关的突变,单核苷酸变体(SNP),单基因紊乱和基因表达研究。bob下载地址

在测序之前,使用几种策略用于序列捕获和富集特异性基因组区域。最常用的方法是杂种捕获富集和基于扩增子的富集。基于扩增子的富集使用分子反转探针(MIP),而杂化的靶富集使用杂交的探针特别用溶液或固体表面上的靶向感兴趣的区域。

Roche测序解决方案提供杂交的基于杂交的目标丰富解决方案,该富集解决方案是集成工作流程的一部分,其包括高质量探头以及精简的KAPA库预备套件。该工作流程使得能够将针对性重新排序应用的排序资源集中在人类遗传疾病和癌症研究中。bob下载地址

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基于杂交的目标富集

探索Kapa目标丰富组合。KAPA过度噪声探头涵盖了CCD,REFSEQ,ENSEMBL,Gencode和Clarvar基因组数据库,以高效〜43 MB捕获目标尺寸。我们的自定义产品:Kapa HyperChoice Probes使用户能够使用HyperDesign工具设计定制人类探针,而Kapa Sperexplore探头则用于较少众所周知或复杂的定制设计,其超出正常边界。

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目标丰富软件

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  1. Kozarewa等。Curr Protoc Mol Biol.,2015.目标浓缩策略概述。