概述

下一代测序(NGS)的DNA样品制备包括几个步骤。每一步都直接影响测序库的质量,对测序结果的可靠性至关重要。简而言之,它涉及到一个适合于特定NGS平台使用的DNA文库的制备。根据最终目标,还将执行目标充实步骤。DNA文库的制备本身包括几个步骤。文库的质量可能取决于DNA样本的性质(例如新鲜样本与福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)组织)、输入量和难度(AC-或GC-rich区域高的样本)。每一步都可能诱发错误或偏差,从而显著影响库的质量。

有了NGS,数以亿计的DNA模板可以并行处理。虽然在某些情况下需要全基因组测序(WGS),但它仍然很昂贵,并产生大量的数据。只对感兴趣的区域进行有针对性的排序提供了一种更具成本效益的替代办法。1当寻找罕见和低频变异时,目标区域的测序提供了所需的深度。目标富集是目标测序的关键步骤,可以集中测序资源,降低成本,简化分析。1

执行库制备和目标富集所需的多个步骤需要从不同的供应商获取试剂,验证它们并确保工作流程之间的兼容性。考虑到NGS样品的珍贵性质,将这些步骤与优化的试剂结合起来的集成工作流程将是有利的。

罗氏公司提供DNA试剂用于文库制备、靶标富集,并将其整合成一个高效、方便的工作流程。

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DNA库制备

探索通过我们的定向进化技术进化出的含有酶和缓冲液的高质量KAPA DNA文库制备试剂。它们以方便、易于使用的主混合配方配制,并提供低偏倚和均匀覆盖的测序文库,无论起始材料的类型和难度如何。

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目标浓缩

寻找目标特异性的基于溶液的杂交探针,以生成高度富集的目标DNA区域。探头既可作为固定面板,也可作为定制设计,并配有高级软件工具。还有一个额外的探索选项。

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集成的工作流

检查一个无缝的工作流程,结合所有步骤和验证试剂所需的DNA库制备和目标富集。HyperCap工作流集成了所有样品准备步骤,提供了从单一供应商订购和支持的便捷性。

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  1. Kozarewa et al。当前议定书Mol Biol。, 2015年。目标浓缩策略概述。